Zpravodajský portál pro moderní generaci, která se zajímá o aktuální dění.
Zajímá tě aktuální dění? Zprávy z domova i ze světa najdeš na zpravodajském webu. Čti reportáže, rozhovory i komentáře z různých oblastí. Sleduj Refresher News, pokud chceš být v obraze.
Nepodařilo se uložit změny. Zkus se nově přihlásit a zopakovat akci.
V případě že problémy přetrvávají, kontaktuj prosím administrátora.
OK
V košickom Ústave lekárskej a klinickej mikrobiológie otestovali od začiatku epidémie 2700 vzoriek. Pozitívnych na koronavírus bolo 81. Aká je podstata laboratórnych analýz a na akých prístrojoch sa testuje?
7. augusta 2019 vo svojom dome v meste Newport Beach v Kalifornii zomiera na zlyhanie srdca 74-ročný americký biochemik Kary Mullis.
Nekonvenčný, výrečný a nepokojný muž, neskrotený génius, surfer a špičkový vedec dostane ako 48-ročný v roku 1993 Nobelovu cenu za chémiu. Konkrétne za objav a zdokonalenie techniky PCR – z anglického „Polymerase Chain Reaction“, teda polymerázovej reťazovej reakcie.
Objaviteľ laboratórnej metódy PCR, Kary Mullis. Zdroj: Flicker/Suzie Katz
V medicíne a molekulárnej biológii sa táto technika dnes bežne používa na diagnostiku mnohých dedičných ochorení a na detekciu infekčných chorôb. V kriminalistike na identifikáciu podozrivých podľa DNA, v lekárskej genetike na určovanie otcovstva.
Jednoducho povedané PCR umožňuje nájsť ihlu v kope sena, a potom z tej ihly urobiť novú kopu a hľadať v nej to, čo potrebujeme zistiť. Šesť mesiacov po Mullisovej smrti zasiahne svet pandémia koronavírusu, a technika PCR patrí k tomu najspoľahlivejšiemu, čo máme.
Odoberanie vzorky pre testovanie koronavírusu. Jarovnice, marec 2020. Zdroj: REFRESHER/Mario Hudák
V tomto článku si prečítaš:
Vďaka čomu a komu dnes môžeme úspešne a rýchlo testovať koronavírus.
Ako a na čom prebieha analýza vzoriek podozrivých na koronavírus
Aké sú jednotlivé fázy testovania vzoriek v košickom nemocničnom laboratóriu
Čo je na práci laboranta najnáročnejšie a akému riziku je vystavený
Ako sa separuje, izoluje a množí vírusová nukleová kyselina
Ako PCR testovanie vzoriek na prítomnosť koronavírusu vyzerá v praxi sa ideme pozrieť do špeciálneho laboratória Ústavu lekárskej a klinickej mikrobiológie Univerzitnej nemocnice Luisa Pasteura v Košiciach.
V priebehu dvoch posledných mesiacov tu otestovali 2700 vzoriek z východného Slovenska, z toho 81 bolo pozitívnych.
Blok číslo 7
Nájsť v obrovskom areáli košickej nemocnice plnom parkov, budov, ľudí a áut mikrobiologické laboratórium je tak trochu ako hľadať koronavírus obyčajnou lupou. Nehovoriac o tom, že oficiálna adresa mikrobiologického ústavu je Trieda SNP 1.
Takže ak sa neopýtate presne na laboratórium, môže sa stať, že zablúdite v nekonečných chodbách fakultnej nemocnice v úplne inej časti metropoly východu.
Tomuto scenáru sa šťastne vyhnem a pár minút pred pol desiatou dopoludnia prejdem vrátnicou univerzitnej nemocnice na Rastislavovej ulici.
Laboratórna časť mikrobiologického ústavu sídli v tejto nemocničnej budove. Zdroj: REFRESHER/Mario Hudák
Obrovská informačná tabuľa ma nasmeruje k bloku číslo 7, kde okrem štvrtej internej kliniky, oddelenia patológie, kliniky dermatovenerológie a psychiatrie sídlia aj laboratóriá lekárskeho mikrobiologického ústavu.
Trochu meškám a keď zistím, že hlavný vchod storočnej historickej budovy je zamknutý, nepatrne znervózniem.
O niekoľko metrov ďalej je bočný vchod s otvorenými železnými dverami. Vedú k dvom starým výťahom. Fajčia pri nich dve zdravotníčky. Pýtam sa na laboratóriá, dievčatá ma výťahom posielajú na prvé poschodie.
Ranné preberanie vzoriek, ktoré sa budú analyzovať. Zdroj: REFRESHER/Mario Hudák
Po sekundovej jazde ma výťah vypľuje do spleti chodieb. Tam ešte pre istotu zablúdim na psychiatriu (chvíľu uvažujem, či by som tu dnes radšej nemal ostať), ale na tretí pokus to dám.
Na druhom konci chodby identifikujem nápis Ustav lekárskej a klinickej mikrobiológie – laboratórna časť. Vypínam psycho-selfie-navigáciu a klopem na malé vysvietené okienko.
„Pán prednosta vás už čaká, ideme hneď za ním,“ preberá ma primárka Lýdia Pastvová. Bežíme po schodoch za prednostom. „Tu prosím počkajte,“ ukazuje na rad červených čakacích kresiel pred vstupom do laboratórnej časti ústavu.
Přidej se do klubu Refresher+ již od 25 Kč
Čo sa dozvieš po odomknutí?
Vďaka čomu a komu dnes môžeme úspešne a rýchlo testovať koronavírus.
Ako a na čom prebieha analýza vzoriek podozrivých na koronavírus
Aké sú jednotlivé fázy testovania vzoriek v košickom nemocničnom laboratóriu
Čo je na práci laboranta najnáročnejšie a akému riziku je vystavený
Ako sa separuje, izoluje a množí vírusová nukleová kyselina
Např.:
Lístok ZDARMA na linke Bratislava – Viedeň/Schwechat
, 15 % zľava na nákup výživových doplnkov VOXBERG
nebo 30-dňová výzva s ChatGPT od Jazykového mentoringu ZDARMA
„Pred týždňom tu boli vaši kolegovia z Korzára, ukázal som im celý pracovný postup,“ víta ma o malú chvíľu na chodbe prednosta ústavu. Profesor mikrobiológie Leonard Siegfried (64) ústavu so 40-timi zamestnancami šéfuje od roku 1991.
„Už prišli všetky vzorky, alebo sa ešte čaká?,“ pýta sa šéf svojich laborantiek v miestnosti s laboratórnym boxom. Stojíme v malej predsieni, kde sa vzorky prijímajú.
„Ešte čakáme,“ hovorí laborantka v overale s respirátorom na tvári a rukami v sterilnom boxe. Tu sa robí prvé, základné spracovanie vzoriek. Fotím. Keď drzo vkročím do malej miestnosti, laborantky z toho vôbec nie sú nadšené.
Prvé spracovanie vzoriek po príjme v sterilnom laboratórnom boxe. Zdroj: UNLP
„Nemáte na hlave kuklu,“ upozorňuje ma prednosta, „toto je sterilné prostredie“. „Našťastie teraz tu ešte vzorky nie sú, ale keď ich laborantka otvorí, musíme byť v plnej zbroji. Overal, okuliare, štít, respirátor, kukla. Aby neprešiel ani jeden vírus,“ dodáva Siegfried.
Dozvedám sa, že primárne spracovávajú, analyzujú a vyhodnocujú vzorky – výtery z nosohltana a z dutiny ústnej, ktoré prichádzajú z tejto nemocnice.
V laboratóriu pracujú s dvoma prístrojovými platformami. S prístrojmi a laboratórnymi setmi od firmy Roche a od firmy Siemens.
Spracované vzorky putujú do separátora. Tu sa izoluje vírusová ribonukleová kyselina RNA. Zdroj: UNLP
„Toto je separátor nukleových kyselín, v tomto prípade vírusovaj RNA. V ňom sa ribonukleová kyselina (RNA) vírusu izoluje a ďalej sa spracováva v druhom laboratórnom boxe. Prístroj vie detegovať už desať prítomných kópií (molekúl) vírusovej RNA. Je to mimoriadne citlivé,“ hovorí prednosta.
„Ďalší postup je taký, že k nukleovej kyseline izolovanej zo vzorky pacienta, sa v laminárnom boxe druhej triedy pridá takzvaný master-mix. To sú ingrediencie, jednotlivé stavebné kamene nukleovej kyseliny – nukleotidy.“
Druhá fáza analýzy vzoriek v PCR termocykléry. Prístroj po desiatkach cyklov množenia RNA vyhodnotí pozitivitu alebo negativitu vzorky. Zdroj: UNLP
„Plus enzým, ktorý zabezpečuje ich spájanie a množenie celej nukleovej kyseliny. Tento druhý krok prebieha v ďalšom špeciálnym prístroji – termocykléry. U nás ich máme dva, ich cena sa pohybuje rádovo v desiatkach tisícov eur,“ vysvetľuje Leonard Siegfried.
Termocyklér je napojený na počítač. Výsledok, teda to, či je vzorka pozitívna alebo negatívna vyhodnocuje špeciálny softvér.
Testy aj kontroly
„Okrem toho, že testujeme vzorky na pozitivitu koronavírusu, robíme aj kontrolné testy hospitalizovaných pacientov po liečbe. Aby sme vedeli či ešte a hlavne dokedy pacient vylučuje koronavírus.“
Aby pacienta mohli prepustiť mal by mať po liečbe dva negatívne testy po sebe. Opakovať sa môžu minimálne 24 hodín po sebe.
Mikrobiologické laboratórium kde sa testujú vzorky na koronavírus. Zdroj: REFRESHER/Mario Hudák
„Najviac sme mali 114 vzoriek za deň. To si už vyžaduje extrémnu pozornosť a osobné nasadenie laborantiek, keďže sa pracuje s minimálnymi množstvami 10 až 30 mikrolitrov vzorky. Okrem toho sú laborantky vystavené pomerne vysokému riziku nákazy, “ hovorí s rešpektom prednosta.
"Termocykléry majú kapacitu cca. 40 vzoriek. Pracujeme na dvojzmennú prevádzku. Ak by sme išli na maximum, denne vieme zanalyzovať 140 vzoriek. Chvalabohu, takáto situácia nevznikla. Za posledných 10 dní sme spracovali 500 vzoriek. Samozrejme ku každej sade analyzovaných vzoriek pridávame pozitívnu a negatívnu kontrolu,“ dodáva.
Prednosta ústavu Leonard Siegfried je optimista. Profesor opatrenia vlády, nosenie rúšok aj disciplínu Slovákov oceňuje. Zdroj: REFRESHER/Mario Hudák
Výsledky sa okamžite po zistení telefonicky oznamujú lekárom na klinickom pracovisku. Potom sa zadávajú do centrálneho registra, ktorý spravuje Úrad verejného zdravotníctva. Odtiaľ sa dostávajú aj k premiérovi, ktorý o stave informuje verejnosť.
„Okrem vzoriek z nemocníc, analyzujeme aj vzorky z domovov sociálnych služieb a z rómskych osád. No momentálne sme už v pokoji. Vidíme, že počet vzoriek a hlavne pozitivít každým dňom klesá,“ hovorí Siegfried.
Prednosta je presvedčený, že vládnymi opatreniami a disciplinovanosťou ľudí sa podarilo epidémiu na Slovensku udržať vo veľmi dobrých číslach.
„Ukazuje sa, že nosenie rúšok naozaj malo zmysel. Ja som však optimista. Myslím si, že situácia nie je až taká dramatická. Každopádne ju nemôžeme podceňovať, no ekonomiku je potrebné čím skôr uvoľniť“ dodáva Leonard Siegfried.